Proteins play a central role in biology from immune recognition to brain activity. While major advances in machine learning have improved our ability to predict protein structure from sequence, determining protein function from structure remains a major challenge. Here, we introduce Holographic Convolutional Neural Network (H-CNN) for proteins, which is a physically motivated machine learning approach to model amino acid preferences in protein structures. H-CNN reflects physical interactions in a protein structure and recapitulates the functional information stored in evolutionary data. H-CNN accurately predicts the impact of mutations on protein function, including stability and binding of protein complexes. Our interpretable computational model for protein structure-function maps could guide design of novel proteins with desired function.
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人为决策的合作努力实现超出人类或人工智能表现的团队绩效。但是，许多因素都会影响人类团队的成功，包括用户的领域专业知识，AI系统的心理模型，对建议的信任等等。这项工作检查了用户与三种模拟算法模型的互动，所有这些模型都具有相似的精度，但对其真正的正面和真实负率进行了不同的调整。我们的研究检查了在非平凡的血管标签任务中的用户性能，参与者表明给定的血管是流动还是停滞。我们的结果表明，虽然AI-Assistant的建议可以帮助用户决策，但用户相对于AI的基线性能和AI错误类型的补充调整等因素会显着影响整体团队的整体绩效。新手用户有所改善，但不能达到AI的准确性。高度熟练的用户通常能够识别何时应遵循AI建议，并通常保持或提高其性能。与AI相似的准确性水平的表演者在AI建议方面是最大的变化。此外，我们发现用户对AI的性能亲戚的看法也对给出AI建议时的准确性是否有所提高产生重大影响。这项工作提供了有关与人类协作有关的因素的复杂性的见解，并提供了有关如何开发以人为中心的AI算法来补充用户在决策任务中的建议。
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未经测量的混杂假设被广泛用于鉴定观察性研究中的因果效应。关于近端推理的最新工作提供了替代性识别结果，即使在没有观察到的混杂因子的存在下，也可以成功，但前提是人们测量了一组足够丰富的代理变量，并满足了特定的结构条件。但是，近端推断需要解决一个不适合的积分方程。先前的方法使用了各种机器学习技术来估计该积分方程的解决方案，通常称为桥梁函数。但是，通常通过依靠预指定的内核函数来限制先前的工作，这些函数不是数据适应性的，并且难以扩展到大型数据集。在这项工作中，我们基于深度神经网络引入了一种灵活且可扩展的方法，以估计存在使用近端推理的混淆的存在。我们的方法在两个公认的近端推理基准上实现了最先进的性能。最后，我们为我们的方法提供理论一致性保证。
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建筑物的智能和连续调试（SCCX）可能会大大减少设计和运营性能之间的差距。本体论在SCCX中起着重要作用，因为它们促进了机器的数据可读性和推理。为了将其开发和纳入SCCX，需要更好地了解本体。本文批判性地回顾了自2014年以来自2014年以来在SCCX域内建立数据本体的最新研究，通过基于建筑数据类型，一般方法和应用程序对它们进行排序。在大多数现有本体论中，已经考虑了建筑信息建模和建筑管理系统的两个主要领域的数据类型。从现有本体论的批判分析中可以明显看出三个主要应用：（1）关键绩效指标计算，（2）建筑物绩效的改善以及（3）故障检测和诊断。文献综述中发现的关键差距是SCCX的整体本体，并了解应如何评估这种方法。基于这些发现，本研究为未来的必要研究提供了建议，包括：与SCCX相关的数据类型的识别，本体学绩效评估以及创建开源方法。
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国际危机如何展开？我们将国际关系概念化为对手之间的战略国际象棋游戏，并开发了一种系统的方法，以准确且一致的历史准确，一致地测量碎片，移动和gam。我们基于国际危机行为（ICB）项目的非常高质量的叙事语料库，介绍了一个名为ICBE的国际事件的新本体和数据集。我们证明，ICBE的覆盖范围，召回和精度比现有数据集的现有状态更高，并进行了两项关于古巴导弹危机（1962）和Crimea-Donbas危机（2014）的详细案例研究。我们进一步介绍了两个新的事件可视化（事件Icongraphy和危机地图），这是一种使用自然语言处理（Sythnetic叙述）测量事件召回的自动基准，以及用于客观测量事件精确度的本体论重建任务。我们在伴侣网站www.crisisevents.org和github存储库中提供数据，在线附录，复制材料以及可视化的可视化材料和可视化。
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我们概述了新兴机会和挑战，以提高AI对科学发现的效用。AI为行业的独特目标与AI科学的目标创造了识别模式中的识别模式与来自数据的发现模式之间的紧张。如果我们解决了与域驱动的科学模型和数据驱动的AI学习机之间的“弥补差距”相关的根本挑战，那么我们预计这些AI模型可以改变假说发电，科学发现和科学过程本身。
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